みなさん、こんにちは。

 

以前、バイオコース２年生の授業（バイオインフォマティックス）で、RasMolをご紹介しました。

今回は、２年生がRasMolを使って、分子構造の特徴をわかりやすく可視化しましたので、２回に分けてご紹介をしたいと思います。

 

RasMolで読み込んだ構造を機能を利用して可視化した構造をご紹介します。

読み込んだ構造と可視化した構造は向きを合わせてありますので、見比べてみてください。

 

RasMolで読み込んだデータです。針金状構造で表示されます。

 

こんな感じに可視化してみました。αヘリックス構造やβシート構造が表示されています。

 

慣れないコマンド入力で頑張って作成しましたので、他の構造も見比べてみてください。

 

Ｎｏ．２

 

Ｎｏ．３

 

いかがですか？αヘリックス構造やβシート構造以外にも、金属原子などが結合しているので、金属原子の表示などもしてみました。

 

次のブログにつづく・・・・・。

 

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みなさん、こんにちは。

 

バイオコース２年生の４期の科目の中にバイオインフォマティクスがあります。

この科目は、コンピュータを使った授業になります。

 

バイオインフォマティクスには、いろいろな訳がありますが、バイオコースでは生物情報学と訳しています。

 

今回は、タンパク質の構造を表示するプログラムソフトのＲａｓＭｏｌを使ってみました。

今回は、ＲａｓＭｏｌに慣れてもらうため、使い方の練習をしましたので、その様子をご覧ください。

 

オープンソースなので、機能的には限界がありますが、チャレンジしてみました。

 

ＲａｓＭｏｌは、コマンド（命令）入力をして操作をします。

なかなか慣れない操作に、少し戸惑いがあるようでした。

どうしてもすぐにクリックをしたくなるようです。

 

２年生のみなさんには、授業で分子構造をＲａｓＭｏｌで表示してもらう予定ですので、できましたらご紹介したいと思います。

 

２年生のみなさん、上手く表示できるように頑張っていきましょう。

 

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