湘央医学技術専門学校・湘央生命科学技術専門学校

応用生物科学科&愛玩動物看護学科BLOG

Tag Archives: バイオインフォマティックス

バイオ通信No.2152「バイオインフォマティックス2-2」

みなさん、こんにちは。

前回のバイオインフォマティックス2-1(RasMol)のつづきです。

 

コマンド入力ということはありますが、RasMolは扱いやすく、慣れてくると戸惑っていた学生もいろいろと試していました。

混乱して、ラベルをちょっと間違ったりもしますが・・・・・。ご了承ください。

それでは、他の構造も見比べてみてください。

 

No.4

 

No.5

 

少しわかりづらいですが、緑色の球状の部分がジスルフィド結合(SS結合)ですね。

No.6

 

みなさん、いかがでしたか?

2年生のみなさん、慣れないコマンド入力、お疲れ様でした。

 

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バイオ通信No.2151「バイオインフォマティックス2-1」

みなさん、こんにちは。

 

以前、バイオコース2年生の授業(バイオインフォマティックス)で、RasMolをご紹介しました。

今回は、2年生がRasMolを使って、分子構造の特徴をわかりやすく可視化しましたので、2回に分けてご紹介をしたいと思います。

 

RasMolで読み込んだ構造を機能を利用して可視化した構造をご紹介します。

読み込んだ構造と可視化した構造は向きを合わせてありますので、見比べてみてください。

 

RasMolで読み込んだデータです。針金状構造で表示されます。

 

こんな感じに可視化してみました。αヘリックス構造やβシート構造が表示されています。

 

慣れないコマンド入力で頑張って作成しましたので、他の構造も見比べてみてください。

 

No.2

 

No.3

 

いかがですか?αヘリックス構造やβシート構造以外にも、金属原子などが結合しているので、金属原子の表示などもしてみました。

 

次のブログにつづく・・・・・。

 

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