みなさん、こんにちは。
バイオコース２年生のバイオインフォマティクスの様子をご覧ください。
今回は、冬休みがあったので、忘れてしまった内容の復習を兼ねて授業を行いました。
植物のrbcL遺伝子のアミノ酸配列をNCBIを使って検索して取得し分子系統樹を作成しました。
画面上なので、わかりづらいと思いますが、ご了承ください。
左右の分子系統樹は同じ系統樹です。
分子系統樹を作成し、ワードに貼り付けて課題提出を行いました。
分子系統樹を作成してみて、少し今まで行った内容を思いだしたみたいですが、結構忘れているようです。
学生の反応も普段の授業や実習とは、少し違う様な気もします。
２年生のみなさん、この授業はまだまだありますので、しっかり頑張っていきましょう。
コンピュータを使った授業は、まずは「習うよりも慣れよ」ですよ。
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みなさん、こんにちは。
今回は、バイオコース２年生のバイオインフォマティクスの授業の様子のご紹介です。
普段は、ピペットを使ったり、培養したりの２年生ですが、コンピュータを使った授業になります。
スマホは使い慣れているけれど、コンピュータはあまり使い慣れていない学生もいますが、頑張って取り組んでいますので、その様子をご覧ください。
この授業は、バイオ関連のサイトの利用方法を中心とした授業ですが、見慣れないことと英語が多いので少し戸惑いもあるようです。
今回は、分子系統樹を作成してみました。ちょっとわかりづらいですが、授業の様子をご覧ください。
こっそりYou Tubeなどを見ていたりと思ったのですが、しっかり取り組んでいます。
今回は、ミトコンドリアの配列を使って分子系統樹を作成しました。
２年生のみなさん、まだまだいろいろなサイトを紹介しますので、しっかり取り組んでいきましょう。
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みなさん、こんにちは。
バイオコース２年生の４期の科目の中にバイオインフォマティクスがあります。
この科目は、コンピュータを使った授業になります。
バイオインフォマティクスには、いろいろな訳がありますが、バイオコースでは生物情報学と訳しています。
今回は、タンパク質の構造を表示するプログラムソフトのＲａｓＭｏｌを使ってみました。
今回は、ＲａｓＭｏｌに慣れてもらうため、使い方の練習をしましたので、その様子をご覧ください。
オープンソースなので、機能的には限界がありますが、チャレンジしてみました。
ＲａｓＭｏｌは、コマンド（命令）入力をして操作をします。
なかなか慣れない操作に、少し戸惑いがあるようでした。
どうしてもすぐにクリックをしたくなるようです。
２年生のみなさんには、授業で分子構造をＲａｓＭｏｌで表示してもらう予定ですので、できましたらご紹介したいと思います。
２年生のみなさん、上手く表示できるように頑張っていきましょう。
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みなさん、こんにちは。
バイオコース２年生のバイオインフォマティクス最後の授業です。
今回は、NCBIのミニコースを授業でやってみました。（内容的には古いのですが・・・）
今までの授業のおさらいのつもりでしたが、２年生のみなさん、気づきましたか？
そしてミニコースの最後は、RasMolを使って分子構造を表示しました。
学生の様子を少しのぞいてみました。見づらいとは思いますが、分子の構造が表示されています。
ちょっとよそ見中のＭ君。カメラ目線より、作業の遅れにつながりますので、しっかり前を向いてください。
これでバイオインフォマティクスの授業は、終了です。
２年生のみなさん、お疲れ様でした。
コンピュータを使った授業で、戸惑いもあったと思いますが、これも経験。
少しはコンピュータに慣れたと思えるならば、良かったと思います。
あとは、課題を忘れずに提出してください。
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みなさん、こんにちは。
前回、ご紹介しましたバイオコース２年生のバイオインフォマティクスの授業で使用したRasMolの続きです。
それでは、２年生の力作？第２弾をご覧ください。
今回は、タンパク質の特徴をシンプルな感じで表現したようです。
タップ、クリックに慣れている学生にとっても、ちょっと大変だったようです。
授業もあと少し。
２年生のみなさん、頑張っていきましょう。
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