みなさん、こんにちは。

今回の２年生の生化学実習では、

タンパク質の定量を行いました。

使用したタンパク質は、

前回分離し透析した卵白アルブミン水溶液です。

久しぶりに使用試薬の調製から行いました。

同時にサンプルの調製も行いました。

最初に、吸収スペクトルの作成を行いました。

タンパク質の極大吸収波長の２８０ｎｍは確認できたかな。

卵白アルブミン水溶液の吸収スペクトルです。

２８０ｎｍ付近に極大吸収がでていますね。

２年生は、手書きの吸収スペクトルを作成中。

さらに、紫外吸収法により

卵白アルブミンの定量（計算法）を行いました。

次に比色分析による定量を行いました。

今回は、タンパク質なので、

ビウレット法によりタンパク質の定量（検量線法）を行いました。

タンパク質標準液のビウレット反応です。

濃度により色の濃さが変わります。

サンプルのビウレット反応です。

サンプルも濃度を変えて測定をします。

測定終了後、

お互いの測定データについて意見交換かな。

今年の２年生は、班だけではなく、

みんなで取り組むことが多いです。

共通認識がもてるので、いい傾向だと思います。

十分な結果が得られ、

卵白アルブミンの定量ができました。

２年生のみなさん、

この調子で頑張っていきましょう。

タンパク質の実習は、あと２回続きます。

しっかり取り組んでいきましょう。

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みなさん、こんにちは。

今回の２年生の生化学実習では、

卵白アルブミンの分離を行いました。

この実習の最初にDNAの分離を行いましたが、

今回はタンパク質の分離です。

それでは、実習の様子をご覧ください。

まずは、卵を卵白と卵黄に分けます。

慎重に慎重に・・・。

次に㏗指示薬を滴加します。

卵白の色が変わります。

次に酢酸を滴加します。

酢酸は酸なので、タンパク質の変性が起こります。

遠心をします。

上清に硫安を加えます。

（塩析です。）

初めての塩析、ちょっと驚きもあったようです。

遠心をします。

再度、硫安により塩析を行います。

沈殿（アルブミン）が生じてきます。

これを遠心し、

沈殿を蒸留水で溶かし、

透析を行います。

初めての透析です。

慣れない操作なので、協力して行います。

透析（脱塩）中です。

次回の実習では、

この卵白アルブミンを使用して、

タンパク質の定量を行います。

２年生のみなさん、

卵白アルブミンの分離はいかかがでしたか。

タンパク質の性質を利用した分離方法なので、

タンパク質の性質の再確認ができたと思います。

次回も頑張っていきましょう。

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みなさん、こんにちは。

バイオコース２年生のバイオインフォマティクスの授業で、

RasMolを使用し、タンパク質の立体構造を

グラフィカルに表示をしてみましたのでご紹介します。

RasMolは、以前のブログでご紹介しましたが、

タンパク質の立体構造をグラフィカルに可視化するプログラムです。

コマンド入力が主になりますので、

慣れないこともありますが、力作をご覧ください。

タンパク質の立体構造データベースのProtein Data Bank(PDB)から

タンパク質のデータをダウンロードして、

RasMolでデータファイルを開いた画像例です。

細い針金状で表示がされます。

この画像はクモの巣みたいですね。

２つ立体構造があります。

こちらは同じデータですが、

Protein Data Bankに載っている画像です。

２つの立体構造のうちの１つが表示されています。

２年生には、それぞれデータをダウンロードして、

RasMolで立体構造をグラフィカルに表示をしてもらいました。

１つずつご紹介したかったのですが、

多くなってしまいますので、まとめてみました。

小さくなってしまいましたが、ご覧ください。

短い作業時間の中で、

わかる範囲でいろいろと工夫をしてくれました。

２年生のみなさん、お疲れさまでした。

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みなさん、こんにちは。

バイオコース２年生のバイオインフォマティクスでＲａｓＭｏｌを使って

分子構造の特徴をグラフィカルに表示しましたのでご紹介します。

ＲａｓＭｏｌは、無料の立体構造を可視化するプログラムです。

タンパク質の立体構造のデータをＲａｓＭｏｌで読み込むと次のような画像が出てきます。

これは、分子構造を針金状で表示したものです。

この針金状に表示された分子構造をグラフィカルに表示していきます。

２年生は各自、別々のタンパク質の立体構造をグラフィカルに表示しましたのでご覧ください。

αヘリックスや含まれる金属元素などリボン状だったり、球状に表示をしました。

第２弾に続きます。

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2年生のタンパク工学実習でタンパク質の結晶化を行いました。

今回用いたタンパク質は、卵白リゾチームです。

結晶化法は、蒸気拡散法という沈殿剤の濃度を徐々に変化させて過飽和状態を達成する方法の一つです。

その中で最も一般的な手法、ハンギングドロップ法を行います。

24穴プレートへ3段階のｐHの違うリザーバー溶液を入れていきます。

テキストを確認しながら入れていきます。

各自、作業していきます。

よそ見しないでね。

各穴の縁にカバーガラスとの機密性を高めるために薄くグリースを塗ります。

カバーグラスにリゾチーム溶液と沈殿剤溶液を混ぜてのせます。

カバーグラスを反転させて、ウエルの上にのせ、密封します。

できたプレートを20℃インキュベーターに静置して結晶を析出させます。

出来た結晶がこちら。。。Mくんの結晶。

Iくんの結晶。

同じ操作をしても出来る結晶はそれぞれですね。

きれいですね♪

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