バイオ通信No.1916「バイオインフォマティクス３」

みなさん、こんにちは。   バイオコース２年生のバイオインフォマティクスで、RasMolを使いました。 RasMolは、分子の立体構造を表示するグラフィックソフトです。   メニューからある程度操作をすることもできますが、コマンドを入力することでより細かな表示ができます。 クリッククリックに慣れている学生には、ちょっと大変な作業だったようです。   PDBのサイトから分子構造のデータをダウンロードします。 ダウンロードしたデータをRasMolで読み込みます。   読み込んだ分子構造は、細い線がいっぱいなこんな感じです。   背景を白色に変えて、分子構造に少し色をつけてみました。   今回は、タンパク質の分子構造なので、ヘリックス構造に色をつけてみました。   タンパク質の立体構造になってきました。   今回使用したタンパク質は、オキシミオグロビン（ヘムタンパク質で、鉄原子を含みます。）です。   ヘム鉄部分に色（赤色）をつけてみました。（写真が反射して、すみません。）   ２年生のみなさん、はじめてのRasMolはいかがでしたか。 残りの授業でも出てきますので、コマンド入力に慣れていきましょう。   ↓↓クリックお願いします